1996「陽気なギャングが地球を回す」第13回サントリーミステリー大賞佳作
2000「オーデュボンの祈り」第5回新潮ミステリー倶楽部賞
2004「アヒルと鴨のコインロッカー」第25回吉川英治文学新人賞
2004「死神の精度」第57回日本推理作家協会賞短編部門
2008「ゴールデンスランバー」第5回本屋大賞、 第21回山本周五郎賞
2014「マリアビートル」第7回大学読書人大賞
2017「ＡＸ アックス」第6回静岡書店大賞［小説部門］

1985「放課後」第31回江戸川乱歩賞
1999「秘密」第52回日本推理作家協会賞（長編部門）
2006「容疑者Xの献身」第134回直木三十五賞、第6回本格ミステリ大賞（小説部門）
2012「ナミヤ雑貨店の奇蹟」第7回中央公論文芸賞
2013「夢幻花」第26回柴田錬三郎賞
2014「祈りの幕が下りる時」第48回吉川英治文学賞

2003「塩の街」第10回電撃ゲーム小説大賞
2006「図書館戦争」「本の雑誌」が選ぶ2006年上半期エンターテインメント第1位
2008「図書館戦争」シリーズ 第39回星雲賞日本長編作品部門

2013「海賊とよばれた男」第10回本屋大賞

1987「我らが隣人の犯罪」第26回オール讀物推理小説新人賞
1989「魔術はささやく」第2回日本推理サスペンス大賞
1991「本所深川ふしぎ草紙」第13回吉川英治文学新人賞
1992「龍は眠る」第45回日本推理作家協会賞（長編部門）
1993「火車」第6回山本周五郎賞
1997「蒲生邸事件」第18回日本SF大賞
1999「理由」第120回直木三十五賞受賞、第17回日本冒険小説協会大賞国内部門大賞
2001「模倣犯」第55回毎日出版文化賞特別賞
2002「模倣犯」第5回司馬遼太郎賞受賞、 第52回芸術選奨文部科学大臣賞
2007「名もなき毒」第41回吉川英治文学賞
2008「ブレイブ・ストーリー」The Batchelder Award"

2007「答えは、昼間の月」第35回創作ラジオドラマ大賞
2007「聖職者」第29回小説推理新人賞
2009「告白」第6回本屋大賞
2012「望郷、海の星」第65回日本推理作家協会賞（短編部門）
2015「ユートピア」第29回山本周五郎賞

1979「風の歌を聴け」第22回群像新人文学賞
1982「羊をめぐる冒険」第4回野間文芸新人賞
1985「世界の終りとハードボイルド・ワンダーランド」第21回谷崎潤一郎賞
1988「ノルウェイの森」第23回新風賞
1995「ねじまき鳥クロニクル」第47回読売文学賞［小説賞］
1999「約束された場所で―underground 2」第2回桑原武夫学芸賞
2009「１Ｑ８４BOOK1.BOOK2」 第44回新風賞

2006「まほろ駅前多田便利軒」直木賞
2012「舟を編む」第9回本屋大賞
2015「あの家に暮らす四人の女」第32回織田作之助賞
2018「ののはな通信」第25回島清恋愛文学賞
2019「ののはな通信」第7回河合隼雄物語賞

「最後の息子」第84回文學界新人賞
2002「パレード」第15回山本周五郎賞
2002「パーク・ライフ」第127回芥川賞
2007「悪人」第61回毎日出版文化賞、 第34回大佛次郎賞
2010「横道世之介」第23回柴田錬三郎賞

1999「ナイフ」坪田譲治文学賞
1999「エイジ」山本周五郎賞
2000「ビタミンF」直木賞
2010「十字架」吉川英治文学賞